Efsanevi Jaeger pilotu ve insanlığın kahramanı olan babasının fedakarlığından yıllarca uzak durmuş, asi ve umursamaz bir hayat süren Jake Pentecost, bir zamanlar umut vadeden bir pilotken eğitimini yarıda bırakıp yeraltı suç dünyasının karanlık sokaklarında kaybolmuştur. Babasının adını ve mirasını arkasında bırakan Jake, hayatını küçük kaçakçılıklar ve yasa dışı işlerle sürdürmektedir.

Ancak dünya, Kaiju tehdidinin tamamen sona erdiğini sanırken, yepyeni ve çok daha yıkıcı bir tehlike insanlığın kapısına dayanır. Bilinmeyen bir güç, şehirleri yerle bir eden ve insanlığı yeniden diz çöktürmeye hazırlanan bir planı hayata geçirir. Tam da bu dönemde Jake’in hayatına yıllardır görüşmediği kız kardeşi Mako Mori yeniden girer. Mako, Jake’e geçmişinden ve babalarının fedakarlığından kaçamayacağını hatırlatarak, ona insanlığın kaderi için savaşma şansı sunar.

Jake, öfkesiyle ve geçmişiyle yüzleşmek zorunda kalırken, dünyanın dört bir yanından toplanmış genç, yetenekli ama deneyimsiz pilot adaylarıyla birlikte yeni nesil Jaeger programının bir parçası olur. İnsanlık, Kaiju tehdidine karşı bir kez daha birleşmek zorundadır. Tek umutları, geçmişin yüklerini geride bırakıp bir arada hareket etmeyi başarabilmektir.

Bu mücadele, sadece dev yaratıklara değil, aynı zamanda Jake’in kendi içindeki korkulara, küskünlüklere ve sorumluluklardan kaçma isteğine karşı da verilecek bir savaştır. İnsanlığın kaderi, birlik ve cesaretin sınandığı bu son savaşta belirlenecektir.