Batman ve müttefikleri, zamanın akışında kaybolduktan sonra nihayet günümüze döndüklerinde, karşılarında bambaşka bir dünya bulurlar. Japonya’nın tamamen ortadan kaybolduğunu, yerine devasa bir adanın Gotham Şehri’nin üzerine kurulduğunu fark ederler. Bu yeni ve korkutucu ada, gökyüzüne uzanan tapınaklar, neon ışıklı sokaklar ve geleneksel Japon mimarisiyle doludur. Ancak, bu büyüleyici görüntünün ardında yozlaşmış bir düzen yatmaktadır.

Adanın zirvesinde, Gotham’a kanun ve düzen getirdiğini iddia eden ancak onur ve insanlıktan yoksun yöntemler kullanan bir güç bulunmaktadır: Yakuza. Ancak bu sıradan bir suç örgütü değildir. Yakuza’nın liderleri, inanılmaz güçlere sahip savaşçılardır ve görünüşleri, Adalet Birliği üyelerine şüpheli bir şekilde benzemektedir. Süper güçlü bu grup, kentin üzerine korku salarak otoritesini sürdürmekte ve Gotham halkını acımasızca yönetmektedir.

Batman, Nightwing, Robin, Batgirl ve Red Hood, bu yozlaşmış düzenin ardındaki gerçeği ortaya çıkarmak için harekete geçer. Yakuza’nın liderlerinin kim olduğunu, nasıl bu güçlere sahip olduklarını ve Adalet Birliği’yle olan bağlantılarını çözmek zorundadırlar. Aynı zamanda, Gotham’ın özgürlüğü için savaşan yeraltı direnişiyle de iş birliği yaparak, halkı bu tiranlıktan kurtarmak için plan yaparlar.

Ancak Batman, karşılarında sadece fiziksel olarak güçlü bir düşman olmadığını kısa sürede anlar. Yakuza, mistik güçler kullanarak gerçekliği bükebilmekte, zihinleri kontrol edebilmekte ve geçmiş ile gelecek arasındaki çizgileri manipüle edebilmektedir. Gotham’ın ve tüm dünyanın kaderi, Batman ailesinin bu bilinmezliğe karşı nasıl mücadele edeceğine bağlıdır.

Bu savaş, sadece fiziksel bir üstünlükle değil, strateji, akıl ve en önemlisi, Gotham halkının umudu ile kazanılacaktır. Batman ve müttefikleri, Yakuza’nın liderlerinin ardındaki sırları çözüp, bu kabusu sona erdirebilecek mi? Yoksa Gotham, sonsuza dek bu yozlaşmış düzenin gölgesinde mi kalacak?